用于预测蛋白质三维结构的人工智能程序AlphaFold,为什么是个突破?

AlphaFold是由DeepMind开发的人工智能程序,专门用于预测蛋白质的三维结构。

通过分析氨基酸序列,AlphaFold能够准确地预测蛋白质的形状,这对理解生物过程和推进药物开发具有重要意义。

蛋白质的形状与理解生物过程和推进药物开发有什么关联?

  • 生物功能蛋白质的三维结构决定其功能。了解结构有助于揭示其在细胞中的作用。
    • 例子:血红蛋白的四级结构允许高效的氧气运输。若结构异常,如在镰状细胞贫血症中,红细胞变形,导致氧气运输效率降低,造成贫血和其他健康问题。
  • 酶活性酶的活性中心依赖于其形状,影响反应的催化效率。
    • 例子:淀粉酶的活性中心结构使其能有效催化淀粉分解为糖分子。任何结构变化可能降低酶的催化效率,导致消化不良或代谢紊乱。
  • 信号传导蛋白质结构参与细胞信号的识别和传递,影响生物过程的调控。
    • 例子:胰岛素受体的结构允许其识别并结合胰岛素,启动葡萄糖摄取的信号传导。如果结构改变,可能导致细胞对胰岛素反应不佳,引发2型糖尿病。
  • 药物靶点药物通过与特定蛋白质结合发挥作用,准确的结构有助于设计高效的药物分子。
    • 例子:HIV蛋白酶抑制剂通过结合HIV蛋白酶的活性位点,阻止病毒复制。精准的蛋白质结构信息使药物设计更高效,从而提高抗HIV药物的疗效。
  • 疾病机制错误折叠的蛋白质与多种疾病相关,研究其结构有助于理解和治疗这些疾病。
    • 阿尔茨海默症与淀粉样蛋白错误折叠有关,形成有害的脑内沉积物。通过研究其折叠过程,科学家可以开发干预措施,防止或减少这些沉积物的形成。

AlphaFold在蛋白质折叠问题上取得了革命性突破,大幅提升了预测的精确度和效率。

为什么蛋白质折叠问题需要取得突破?

  • 生物功能:蛋白质的功能与其三维结构密切相关,了解其结构有助于理解其生物功能。
    • 例子:蛋白质如肌动蛋白和肌球蛋白的正确折叠是肌肉收缩的基础。了解它们的结构可以揭示运动和细胞移动的机制。
  • 疾病研究许多疾病与蛋白质错误折叠有关,准确预测结构可以帮助研究疾病机制。
    • 例子:朊病毒疾病(如疯牛病)由蛋白质错误折叠引起。研究其折叠机制有助于理解疾病传播和发展,为治疗提供线索。
  • 药物开发:了解蛋白质结构可以加速新药的设计和开发,提高药物的靶向性和有效性。
    • 例子:G蛋白偶联受体(GPCRs)是许多药物的靶点。了解其结构可以帮助设计更有效的药物,如抗过敏药物和β受体阻滞剂。
  • 科研进展突破这一难题可以推动生物学、医学等多个领域的研究进展。 
    • 例子:蛋白质折叠的突破推动了合成生物学的进展,使得设计合成蛋白质成为可能,用于工业、医学和环境应用。

那人工智能程序AlphaFold是如何工作的呢?

  • 深度学习模型:利用大型神经网络,从已知蛋白质结构中学习序列与三维形状的关系。
  • 进化数据:分析同源序列的多序列比对,提取进化信息,找出保守区域和相关性。
  • 物理约束:结合蛋白质物理化学特性,确保预测结构在生物上合理。
  • 迭代优化:通过反复调整和优化,细化预测结果,使其更接近真实结构。

未来,随着技术进步和数据积累,人工智能程序将在医疗领域发挥更大作用,提高医疗效率和患者护理水平。

在新加坡,人工智能在医疗上的运用和未来发展前景非常广阔:

  1. 智能诊断:新加坡致力于利用AI进行疾病早期检测,提升诊断准确率。
  2. 个性化医疗:通过大数据和AI技术,推动个性化治疗方案的制定,改善患者预后。
  3. 医疗机器人:AI驱动的机器人手术和护理设备在新加坡医院中逐步普及,提高医疗服务质量。
  4. 健康管理:利用可穿戴设备和AI进行健康数据监测,支持慢性病管理和预防保健。
  5. 药物开发:加速药物研发和临床试验,促进医药创新。

AimSG平台是新加坡政府推出的人工智能治理和道德框架,旨在促进人工智能技术的负责任使用,确保AI系统的透明性、公平性和安全性。新加坡政府与医疗机构积极合作,推动AI在医疗领域的研究和应用,预计未来将进一步提升医疗系统的效率和创新能力。

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鲸小编